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水闸多修建在土基上，是既挡水又泄水的建筑物。当水闸挡水时，在上下游水位差的作用下，闸基和两岸均易产生渗流，渗流所产生的向上的渗透压力会削减水闸的有效重量；上下游水位差较大，产生的水平向水压力也较大，有可能使水闸向下游滑动，降低了水闸的抗滑稳定性。因此，水闸必须有足够的重量维持自身的稳定。
渗流还可能引发闸基和两岸的管涌和流土等渗透变形，严重时会使闸基和两岸的土壤被淘空，危及水闸的安全。因此，水闸应有妥善的防渗设施，防止产生渗透变形。
水闸过水时，过闸水流具有较大的动能，对下游会产生严重的冲刷，引起水闸失事。因此，水闸下游必须采取有效的消能防冲设施，防止产生冲刷破坏。
土基上的水闸，由于地基的抗剪强度低，压缩性较大，在自重和外荷载的作用下，可能产生较大的沉陷，导致水闸倾斜，严重的会引起水闸断裂。因此，必须选择合理的水闸形式、施工程序及地基处理的方法等，以减小过大沉降和不均匀沉降。